aplikasi metode maximum parsimony untuk identifikasi kekerabatan jenis virus dan penyebaran epidemi ebola melalui pembentukan pohon filogenetik
tri andriani
Institut teknologi sepuluh november surabaya
Abstract
penyakit ebola adalah penyakit yang disebabkan oleh sejenis virus dari genus ebolavirus, famili filoviridae. Ebola telah ada sebagai endemik menular sejak tahun 1976 di Afrika Tengah. Virus ebola diklasifikasikan ke dalam lima jenis yaitu zaire ebolavirus, sudan ebolavirus, bundibugyo ebolavirus, tai forest ebolavirus yang juga dikenal sebagai cote dIvoire ebolavirus dan reston ebolavirus adalah satu-satunya virus yang tidak menyerang manusia, namun memyerang monyet Identifikasi kekerabatan jenis virus ebola dan penyebarannya dapat dilakukan dengan menggunakan pohon filogenetik. Pada penelitian ini, pohon filogenetik dibangun dengan metode berbasis fitur yaitu metode maximum parsimony yang didalamnya terdapat multiple alignment, sehingga proses pembentukan pohon filogenetik berlangsung lebih efisien sebab dapat dilakukan penyejajaran keseluruhan sekuens sekaligus.
Keywords: metode maximum parsimony, multiple alignment, pohon filogenetik, virus ebola
Topic: Komputasi dan Pemodelan (COM)