Indonesia Conference Directory

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) adalah salah satu kanker yang paling mematikan di dunia. Pada beberapa penelitian menunjukkan bahwa PDAC sering ditandai dengan adanya mutan protein Kirsten Rat Sarcoma (KRAS) G12D, G12V dan G12R. Mutan tersebut merupakan target potensial untuk imunoterapi karena memiliki potensi sebagai neoantigen yang spesifik terhadap kanker. KRAS G12D, G12V dan G12R mengandung epitop imunogenik yang cocok untuk vaksinasi. Epitop KRAS G12D, G12V dan G12R dipresentasikan pada major histocompatibility complexes (MHC) kelas I. Epitop vaksin yang didesain secara rasional dapat menghasilkan respon imun yang terkendali. Dengan adanya perkembangan pustaka data struktural peptida dan pengetahuan yang lebih tentang proses presentasi MHC dan antigen, desain rasional vaksin peptida dapat meningkatkan efektifitas imunoterapi kanker. Sebelum melakukan prediksi aktivitas peptida terhadap MHC, peptida tersebut harus dibuat ke dalam struktur 3D, yaitu dengan Homology Modeling. Pada penelitian ini digunakan I-TASSER untuk melakukan Homology Modeling dengan aplikasi-aplikasi lain sebagai pendukung. Dengan penggunaan metode berbasis in silico dalam memprediksi epitop untuk memproduksi vaksin peptida yang telah didesain secara rasional dapat meningkatkan efikasi vaksin tersebut. Dari hasil penelitian didapatkan model 5 epitop yang memiliki Afinitas ikatan yang kuat dengan MHC I, yaitu KSFEDIHHYR, GIPFIETSAK, VVVGARGVGK, FYTLVREIRK dan VVVGADGVGK.